Mise place des systèmes racinaires

Table des matières

Liste des Abréviations
Introduction Générale
I.Systèmes racinaires
I.1 Définition d’un système racinaire
I.2 Comparaison des systèmes racinaires du riz et d’Arabidopsis thaliana
I.3 Mise place des systèmes racinaires
II.Le Cortex
II.1 Origine et évolution du cortex
II.2 L’inner-cortex et sa régulation
II.3 Variation du nombre de couches de cortex selon les types racinaires
III. Contrôle de la mise en place des tissus internes chez Arabidopsis thaliana
III.1 AtSHR et AtSCR : deux gènes clefs impliqués dans la formation du cortex chez A.thaliana
III.2 Modèle moléculaire de la mise en place des tissus internes
IV.Orthologues à AtSHR
IV.1 Conservation et évolution des protéines SHR
IV.2 Les orthologues du riz
V.Problématique de la thèse
CHAPITRE I : Formation et identité cellulaire du cortex
Introduction
I.Caractérisation des deux types de cortex
I.1 Différences anatomiques entre l’endoderme et le cortex
I.2 Origine de la couche d’inner-cortex
II.L’inner et l’outer cortex présentent des signatures moléculaires distinctes
III. Le cortex dans les racines latérales : présence d’outer-cortex et absence d’inner-cortex
III.1 Différences anatomiques entre les 3 types de racines latérales
III.2 Identification des tissus internes dans les différents types de racines latérales
Conclusion
CHAPITRE II : Mécanismes moléculaires de la mise en place du cortex
Introduction
I.La surexpression des gènes SHR engendre la formation de couches surnuméraires de cortex
I.1. Phénotypage des lignées transgéniques
I.2 Corrélation entre phénotype et niveau d’expression des gènes SHR dans la plante
I.3 Régulation des SHR et réseau de gènes
Conclusion : un rôle commun des gènes SHR dans la mise en place du cortex racinaire, mais via des mécanismes distincts
II.Analyse de la mobilité des protéines SHR1, SHR2 et AtSHR dans le riz
II.1 Etude de la localisation des transcrits SHR
II.2 Analyses des fusions traductionnelles chez le riz
Conclusion : la protéine SHR2 plus mobile que SHR1 ?
III. Création de mutants perte de fonction
Introduction
III.1 Criblage d’une population TILLING
III. 2 Lignées transgéniques perte de fonction (Knock-down et Knock-out)
Conclusion générale : Rôles des gènes SHR dans la mise en place du cortex
CHAPITRE III : Etude de l’expression d’OsSHR1 dans le développement du cal et de la plante
Introduction
I.Etude de l’expression d’OsSHR1 au cours du développement de la plante
I.1 OsSHR1 est exprimé dès la germination
I.2 Profil d’expression d’OsSHR1 en réponse à différents signaux environnementaux
I.3 Conclusion : OsSHR1 a une expression stable au cours du temps
II.Etude de l’expression d’OsSHR1 au cours de la callogénèse et de la régénération
II.1 Profil d’expression d’OsSHR1 sur le milieu d’induction
II.2 Profil d’expression d’OsSHR1 sur le milieu de régénération
II.3 Conclusion : rôles d’OsSHR1 durant la callogénèse et la régénération
III. Etude de la régénération des plantes transgéniques OsSHR1
Conclusion générale : rôle de SHR1 dans la callogénèse
Discussion et Perspectives
Le cortex du riz présente des propriétés communes avec celui d’A.thaliana
SHR1 et SHR2 interviennent dans la mise en place du cortex
Perspectives à plus longs termes
Matériels et Méthodes
Matériels
Kits
Matériel végétal
Méthodes
Extraction des acides nucléiques
Analyses protéiques
Colorations
Clonages
Transformation du riz
Test antibiotique
Phénotypage racinaire des lignées TILLING
Milieux de culture, solutions, tampons
Annexes
Publications
Bibliographie