Les bilharzioses ou schistosomoses

Table des matières

Introduction générale
Chapitre 1: Matériel et méthodes
I. Matériel
II. Méthodes de parasitologie
A. Extraction des parasites
1. La population humaine
2. La population murine
B. Collecte et transport des mollusques
1. Collecte des mollusques
2. Examen parasitologique
3. Transport des mollusques
C. Maintien des cycles des parasites
1. Infestation des hôtes intermédiaires
2. Infestation des hôtes définitifs
D. Maintien des hôtes
1. Elevage des mollusques
2. Elevage des souris
E. Mesure des traits d’histoire de vie du mollusque
1. Croissance
2. Fécondité
3. Survie
F. Mesure des traits d’histoire de vie du parasite
1. Taux d’infestation
2. Période prépatente
3. Production cercarienne
III. Méthodes de Biologie moléculaire
A. Extraction d’ADN de mollusque
B. Réaction de polymérisation en chaine (PCR)
C. Electrophorèse
D. Analyse microsatellite
E. Séquençage
Chapitre 2: Analyse des données
I. Analyse des données de traits d’histoire de vie
A. Test de Student
B. Analyse univariée de la variance
C. Test F d’égalité des variances
D. Analyse de variance (ANOVA)
E. Post-hoc test de Tukey
F. Test de Mann-Whitney
G. Test de Kruskal-Wallis
H. Post-hoc test de Dunn
I. Fisher’s Exact test
J. Test du Khi-deux
K. Test de Logrank
L. Régression linéaire
M. Test de comparaison des pentes
N. Autocorrélation
O. Analyse en Composantes Principales (ACP)
II. Les analyses génétiques
A. Analyses de la diversité génétique
1. Paramètres de la diversité génétique
2. L’indice de fixation FIS
3. Taux d’autofécondation
4. Déséquilibre de liaison
5. Effectif efficace
6. Détection d’un goulot d’étranglement
B. Analyse de la différenciation génétique
1. L’indice de Fixation FST
2. Analyses des correspondances (ACP & AFC)
3. Dendrogramme
4. L’AMOVA (Analyse of MOlecular VAriance)
5. Les distances génétiques
6. Estimation du temps de divergence
7. Taux de migration
8. Isolement par la distance: le test de Mantel
Conclusion générale