Les ruminants domestiques

Table des matières

INTRODUCTION
CHAPITRE I – INTRODUCATION GÉNÉRALE-
CONTEXTE ET ENJEUX
OBJECTIFS DE LA THÈSE
CHAPITRE II – CIRCULATION DE COXIELLA BURNETII EN ÉLEVAGE : DU GÉNOTYPE AU PHÉNOTYPE
ÉTAT DES CONNAISSANCES
II.1 Caractéristiques de l’agent étiologique
II.1.1 Différenciation cellulaire et variations de phase
II.1.2 Potentiel infectieux
II.2 Caractéristiques de l’infection chez l’animal
II.2.1 Voies d’excrétion
II.2.2 Voies de contamination
II.2.2.1 Voie aérienne
II.2.2.2 Voie alimentaire
II.2.2.3 Autres voies de transmission
II.2.3 Réponse immunitaire
II.2.4 Réservoirs et espèces sensibles
II.2.4.1 Réservoirs principaux : les ruminants domestiques
II.2.4.2 Autres espèces animales ; exemple du cheval
II.3 Méthodes diagnostiques
II.3.1 Enzyme-linked Immunosorbent Assay (ELISA)
II.3.2 Real-time PCR
II.4 Prophylaxie
II.4.1 Prophylaxie sanitaire
II.4.2 Prophylaxie médicale
II.5 Étude de la diversité génotypique
II.5.1 Typages moléculaires
II.5.1.1 MLVA
II.5.1.2 MST
II.5.1.3 Élément d’insertion IS1111
II.5.1.4 SNP
II.5.1.5 RFLP
II.5.2 Séquençage total du génome
II.6 Caractérisation phénotypique
II.6.1 Isolement à partir d’échantillons de terrain
II.6.2 Test de viabilité : PCR avec ethidium ou propidium monoazide
II.6.3 Modèles d’infections
II.6.3.1 In vitro sur lignées macrophagiques
II.6.3.2 In vivo sur souris
II.6.3.3 Autres modèles
II.6.4 Virulence des souches séquencées
CONCLUSION