PFE & RAPPORT COMPLEXE Anopheles gambiae A MADAGASCAR : CARACTERISATION MOLECULAIRE ET VARIABILITE GENETIQUE PDF
INTRODUCTION
Chapitre 1 : GENERALITES ET PROBLEMATIQUE DE L’ETUDE
1. HISTORIQUE DU PALUDISME
1.1. Dans le monde
1.2. A Madagascar.
2. SITUATION DU PALUDISME
2.1. En Afrique tropicale
2.2. A Madagascar
3. COMPLEXE Anopheles gambiae
3.1. Spéciation
3.2. Biologie et répartition géographique
3.2.1. Anopheles gambiae sensus stricto
3.2.2. Anopheles arabiensis
3.2.3. Espèces d’eau saumâtre
3.2.4. Anopheles quadriannulatus
3.2.5. Anopheles bwambae
4. LUTTE ANTIVECTORIELLE
4.1. Lutte antilarvaire
4.2. Lutte antiadulte
5. MADAGASCAR ET SES CARACTERISTIQUES
5.1. Relief
5.1.1. Hautes Terres Centrales
5.1.2. Marges des Hautes Terres Centrales
5.1.3. Versant oriental
5.1.4. Zone sédimentaire du littoral occidental
5.2. Climat
5.2.1. Facteurs climatiques
5.2.2. Zones climatiques
6. GENETIQUE DES POPULATIONS
6.1. Principe
6.2. Approches expérimentales
6.2.1. Méthode directe
6.2.2. Méthode indirecte
6.3. Modèles mathématiques
6.4. Marqueurs génétiques en biologie des populations
6.4.1. Isoenzymes
6.4.2. RAPD (Random Amplified Polymorphism DNA)
6.4.3. RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism)
6.4.4. Microsatellites
7. TECHNIQUE DE POLYMERASE CHAIN REACTION « PCR »
7.1. Principe
7.2. Amplification
8. OBJECTIFS
Chapitre 2 : COMPLEXE Anopheles gambiae A MADAGASCAR
1. ADN RIBOSOMIAL (ADNr)
2. MATERIELS ET METHODES
2.1.1. Stade adulte
2.1.2. Stade aquatique
2.2. Identification morphologique
2.3. Extraction de l’ADN génomique
2.4. Identification moléculaire du complexe Anopheles gambiae
2.4.1. Amorces utilisées
2.4.2. Amplification in-vitro ou PCR
2.5. Spéciation Anopheles gambiae s.s.
2.5.1. Amorces utilisées
2.5.2. Amplification in – vitro ou PCR
2.6. Electrophorèse
2.7. Analyse des séquences ITS (Internal Transcripted Spacer).
3. RESULTATS
3.1. Membres du complexe Anopheles gambiae
3.1.1. Répartition des spécimens testés
3.1.2. Constituants des membres du complexe
3.2. Répartition géographique
3.2.1. Anopheles arabiensis
3.2.2. Anopheles gambiae s.s
3.2.3. Anopheles merus
3.3. Spéciation Anopheles gambiae s.s
3.3.1. Répartition des spécimens testés
3.3.2. Résultats sur la spéciation
4. DISCUSSIONS
Chapitre 3 : VARIABILITE GENETIQUE ET COMPORTEMENT TROPHIQUE Anopheles gambiae s.s..
INTRODUCTION
1. MICROSATELLITES
1.1. Caractéristiques générales
1.2. Avantages et propriétés
1.3. Contraintes
1.3.1. Contraintes de taille des allèles
1.3.2. Phénomène d’homoplasie
1.3.3. Taux de mutation hétérogène
1.3.4. Existence d’allèles nule
2. MATERIELS ET METHODES
2.1. Sites d’études
2.2. Méthode d’échantillonnage
2.2.1. Caractéristiques des pièges à odeur OBET
2.2.2. Analyses statistiques
2.3. Identification moléculaire
2.4. Variabilité génétique
2.4.1. Marqueurs microsatellites
2.4.2. Amplification in – vitro.
2.4.3. Révélation des allèles
2.5. Analyses statistiques
2.5.1. Ecart à l’équilibre de Hardy – Weinberg
2.5.2. Déséquilibre de liaison entre paire de loci
2.5.3. Test d’homogénéité des fréquences alléliques
2.5.4. Différentiation génétique entre population
2.5.5. Tests de Bonferroni
3. RESULTATS
3.1. Echantillonnage
3.1.1. Espèces capturées
3.1.2. Indice d’anthropophilie (IA) d’Anopheles gambiae s.s
3.2. Variabilité génétique
3.2.1. Polymorphisme aux loci microsatellites
3.2.2. Equilibre d’Hardy – Weinberg.
3.2.3. Déséquilibre de liaison
3.2.4. Différentiation génétique
4. DISCUSSIONS
4.1. Comportement trophique
4.2. Variabilité
CONCLUSION ET PERSPECTIVES
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Malgré les efforts menés depuis environ un siècle, sur la lutte contre le paludisme, la maladie n’a cessé de sévir dans une grande partie du monde notamment dans le monde tropical et subtropical, observations démontrées par les cartes du paludisme. Les données de l’Organisation Mondiale de la Santé (O.M.S.) estiment que 2,4 milliards d’êtres humains, réparties dans plus de 90 pays, seraient sous la menace de cette maladie, soit 40% de la population mondiale.
L’incidence mondiale est estimée à 300 – 500 millions de cas par année dont 90% surviennent en Afrique subsaharienne. Sur les 1 à 2,5 millions de décès par an, 85% d’entre eux surviennent en Afrique subsaharienne où 74% de la population vivent dans des zones de forte endémie et 18% dans des zones d’épidémie. Le paludisme représente encore 5% du taux de mortalité des enfants de moins de 5 ans en Afrique (O.M.S. 1998).
